Pop & Jazz Konservatorio tekee aktiivista yhteistyötä monella sektorilla, vuosittaisen kumppanuusstrategian mukaisesti.
Oppilaitos on rytmimusiikin koulutuksen valtakunnallinen kehittäjä ja suunnannäyttäjä, jota roolia vahvistavat säännöllisin väliajoin PJKlla järjestettävät rytmimusiikin syyspäivät. PJK toimii verkostoyhteistyössä myös Suomen Konservatorioliiton ja Suomen Musiikkioppilaitosten liiton kanssa.
PJK tekee musiikkialan ammattiopiskelijoiden työelämäyhteistyöhön liittyvää yhteistyötä useiden Helsingin klubien, ravintoloiden ja ohjelmatoimistojen kanssa, joista mainittakoon Bar Loose ja On the Rocks.
Pop & Jazz Konservatorio tekee aktiivista yhteistyötä Helsingin kulttuurin ja liikunnan toimialan kanssa, joka myös rahoittaa konservatorion toimintaa.